Zu den untersuchten Mikroorganismen gehören Bakterien, Hefen, Schimmelpilze und Protozoen. Die Mikrobiologie, die im 17. Jahrhundert von Robert Hooke, Anton van Leeuwenhoek und Marcello Malpigi begründet wurde, erlangte im 19. Jahrhundert dank der Forschungen von Louis Pasteur und Robert Kocht Bedeutung für die Medizin. Mikromanipulatoren, die chirurgische Experimente an lebenden mikroskopisch kleinen Tieren ermöglichen, wurden in der Neuzeit für Arbeiten von unglaublicher Feinheit eingesetzt. Teh Ping Ling erfand 1967 in San Francisco eine Technik zur Injektion winziger Flüssigkeitsmengen in befruchtete Mauseier mit Hilfe von Mikrospritzen und Mikropipetten mit scharfen Öffnungen.
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